فهرست آنزیمها
آنزیمها را براساس واکنش شیمیایی که کاتالیز میکنند طبق شماره کمیسیون آنزیم (EC number) شماره گذاری میکنند
نامگذاری
- در گذشته بر اساس پیش‌ماده نامگذاری می‌شد که به آخر آنها از پسوند "از" اضافه می‌شد مثل پروتئاز
- روش دیگر بر اساس کاری که آن آنزیم انجام می‌دهد مثل دهیدرژناز
- روش پیشرفته تر براساس کاری که انجام می‌دهد و نام پیش‌ماده الکل دهیدرژناز
- روش استاندارد (EC numbers) که در این روش آنزیمها رده‌بندی شده و رده‌ها به زیررده تقسیم شده و در نهایت هر آنزیم کد مخصوص به خود می‌گیرد مثل EC ۱.۱.۱.۸۶ این رده‌ها به شکل زیر است
- ۱-اکسیدو رداکتازها (EC 1)
- ۲-ترانسفرازها (EC 2)
- ۳-هیدرولازها (EC 3)
- ۴-لیازها (EC 4)
- ۵-ایزومرازها (EC 5)
- ۶-لیگازها (EC 6)
طبقه بندی استاندارد
۱-اکسیدو رداکتازها (EC 1)
1.1 گروه:EC 1.1 (act on the CH-OH group of donors)
1.2 گروه:EC 1.2 (act on the aldehyde or oxo group of donors)
1.3 گروه:EC 1.3 (act on the CH-CH group of donors)
1.4 گروه:EC 1.4 (act on the CH-NH2 group of donors)
1.5 گروه:EC 1.5 (act on CH-NH group of donors)
1.6 گروه:EC 1.6 (act on NADH or NADPH)
1.7 گروه:EC 1.7 (act on other nitrogenous compounds as donors)
1.8 گروه:EC 1.8 (act on a sulfur group of donors)
1.9 گروه:EC 1.9 (act on a heme group of donors)
1.10 گروه:EC 1.10 (act on diphenols and related substances as donors)
1.11 گروه:EC 1.11 (act on peroxide as an acceptor -- peroxidases)
1.12 گروه:EC 1.12 (act on hydrogen as a donor)
1.13 گروه:EC 1.13 (act on single donors with incorporation of molecular oxygen)
1.14 گروه:EC 1.14 (act on paired donors with incorporation of molecular oxygen)
1.15 گروه:EC 1.15 (act on superoxide radicals as acceptors)
1.16 گروه:EC 1.16 (oxidize metal ions)
1.17 گروه:EC 1.17 (act on CH or CH2 groups)
1.18 گروه:EC 1.18 (act on iron-sulfur proteins as donors)
1.19 گروه:EC 1.19 (act on reduced flavodoxin as donor)
1.20 گروه:EC 1.20 (act on phosphorus or arsenic as donors)
1.21 گروه:EC 1.21 (act on X-H and Y-H to form an X-Y bond)
1.22 گروه:EC 1.97 (other oxidoreductases)
۲-ترانسفرازها (EC 2)
2.1 گروه:EC 2.1 (transfer one-carbon groups, Methylase)
2.2 گروه:EC 2.2 (transfer aldehyde or ketone groups)
2.3 گروه:EC 2.3 (acyltransferases)
2.4 گروه:EC 2.4 (glycosyltransferases)
2.5 گروه:EC 2.5 (transfer alkyl or aryl groups, other than methyl groups)
2.6 گروه:EC 2.6 (transfer nitrogenous groups)
2.7 گروه:EC 2.7 (transfer phosphorus-containing groups)
2.8 گروه:EC 2.8 (transfer sulfur-containing groups)
2.9 گروه:EC 2.9 (transfer selenium-containing groups)
۳-هیدرولازها (EC 3)
3.1 گروه:EC 3.1 (act on ester bonds)
3.2 گروه:EC 3.2 (act on sugars - glycosylases)
3. گروه:EC 3.3 (act on ether bonds)
3.4 گروه:EC 3.4 (act on peptide bonds - Peptidase)
3.5 گروه:EC 3.5 (act on carbon-nitrogen bonds, other than peptide bonds)
3.6 گروه:EC 3.6 (act on acid anhydrides)
3.7 گروه:EC 3.7 (act on carbon-carbon bonds)
3.8 گروه:EC 3.8 (act on halide bonds)
3.9 گروه:EC 3.9 (act on phosphorus-nitrogen bonds)
3.10 گروه:EC 3.10 (act on sulfur-nitrogen bonds)
3.11 گروه:EC 3.11 (act on carbon-phosphorus bonds)
3.12 گروه:EC 3.12 (act on sulfur-sulfur bonds)
3.13 گروه:EC 3.13 (act on carbon-sulfur bonds)
۴-لیازها (EC 4)
4.1 گروه EC 4.1 : (carbon-carbon lyases)
4.2 گروه:EC 4.2 (carbon-oxygen lyases)
4.3 گروه:EC 4.3 (carbon-nitrogen lyases)
4.4 گروه:EC 4.4 (carbon-sulfur lyases)
4.5 گروه:EC 4.5 (carbon-halide lyases)
4.6 گروه:EC 4.6 (phosphorus-oxygen lyases)
۵-ایزومرازها (EC 5)
5.1 گروه:EC 5.1 (racemases and epimerases)
5.2 گروه:EC 5.2 (cis-trans-isomerases)
5.3 گروه:EC 5.3 (intramolecular oxidoreductases)
5.4 گروه:EC 5.4 (intramolecular transferases -- mutases)
5.5 گروه:EC 5.5 (intramolecular lyases)
5.6 گروه:EC 5.99 (other isomerases)
۶-لیگازها (EC 6)
6.1 گروه:EC 6.1 (form carbon-oxygen bonds)
6.2 گروه:EC 6.2 (form carbon-sulfur bonds)
6.3 گروه:EC 6.3 (form carbon-nitrogen bonds)
6.4 گروه:EC 6.4 (form carbon-carbon bonds)
6.5 گروه:EC 6.5 (form phosphoric ester bonds)
6.6 گروه:EC 6.6 (form nitrogen-metal bonds)
برخی از آنزیم‌های مهم عبارتند از:
آنزیم‌های فعال در حمله آنزیمی
آنزیم همتاسازی مولکولی
اندونوکلئازهای محدودکننده
- SacI
- SalI
- HindIII
- BamI
- EcoRI
- KpnI
- XbaI
- XhoI
- PstI
جستارهای وابسته
| فعالیت | |
|---|---|
| قواعد | |
| دسته‌بندی | |
| سینتیک | |
| انواع |
|