Мы используем файлы cookie.
Продолжая использовать сайт, вы даете свое согласие на работу с этими файлами.
تغذیه
اسید آمینه پروتئین‌زا
Другие языки:

اسید آمینه پروتئین‌زا

Подписчиков: 0, рейтинг: 0

اسید آمینه‌های پروتئین‌زا یا اسید آمینه‌های استاندارد، اسید آمینه‌هایی هستند که مستقیماً در ساختار پروتئین‌ها بکار می‌روند و تعداد آنها ۲۰ عدد می‌باشد. علاوه بر این اسید آمینه‌ها، اسید آمینه‌های غیر استاندارد نیز وجود دارندکه برای ساخت پروتئین پس از ترجمه سلولی و تغییر شرکت میکنند.[1] اسیدهای آمینه دیگری هم وجود دارند که مانند GABA، L-DOPA یا تری یدوتیرونین، پروتئین زا نیستند. برخی از اسیدهای آمینه غیر پروتئین زا در پپتیدهای غیر ریبوزومی ترکیب می شوند که توسط سنتتازهای پپتید غیر ریبوزومی سنتز می شوند. گرچه هم یوکاریوت ها و هم پروکاریوت ها می توانند سلنوسیستئین را از طریق یک توالی نوکلئوتیدی که به عنوان عنصر SECIS شناخته می شود، وارد پروتئین های خود کنند، و سلول را هدایت می کند تا کدون UGA مجاور را به عنوان سلنوسیستئین ترجمه سلولی کند.در برخی از پروکاریوت های متانوژن، کدون UAG (به طور معمول یک کدون متوقف است) نیز می تواند به پیرولیزین ترجمه سلولی شود.[2] در میان یوکاریوت ها، تنها 21 اسید آمینه پروتئین زا، 20 مورد از کد ژنتیکی استاندارد، به علاوه سلنوسیستئین وجود دارد. انسان ها می توانند 12 عدد از این آمینواسیدها را از یکدیگر یا از مولکول های واسطه دیگر متابولیسم و سنتز کنند. 9 مورد دیگر باید به صورت خوراکی (معمولاً به عنوان مشتقات پروتئینی آنها) مصرف شوند، بنابراین آنها را اسیدهای آمینه ضروری می نامند. اسیدهای آمینه ضروری عبارتند از هیستیدین، ایزولوسین، لوسین، لیزین، متیونین، فنیل آلانین، ترئونین، تریپتوفان و والین (یعنی H، I، L، K، M، F، T، W، V).[3] مشخص شده است که آمینو اسیدهای پروتئین زا مربوط به مجموعه ای از اسیدهای آمینه هستند که می توانند توسط سیستم های اتوآمینواسیلاسیون ریبوزیم شناسایی شوند.[4] بنابراین، اسیدهای آمینه غیر پروتئین زا با موفقیت تکاملی احتمالی اشکال حیات مبتنی بر نوکلئوتید حذف می‌شوند. دلایل دیگری برای توضیح اینکه چرا اسیدهای آمینه خاص غیر پروتئین زا به طور کلی در پروتئین ها گنجانده نمی شوند، ارائه شده است. به عنوان مثال، اورنیتین و هموسرین در برابر ستون فقرات پپتیدی چرخه (حلقوی) می شوند و پروتئین را با نیمه عمر نسبتاً کوتاه تکه تکه می کنند، در حالی که سایرین سمی هستند زیرا ممکن است به اشتباه در پروتئین ها مانند کاناوانین آنالوگ آرژنین ترکیب شوند. انتخاب تکاملی اسیدهای آمینه پروتئین زا بویژه از مواد اولیه به دلیل ترکیب بهتر آنها در یک زنجیره پلی پپتیدی در مقایسه با اسیدهای آمینه غیر پروتئین زا پیشنهاد شده است.[5]

ساختارها

ساختار و نماد ۲۰ اسید آمینه

آمینه‌های غیر استاندارد

خواص شیمیایی

خواص شیمیایی کلی

Amino Acid Short Abbrev. Avg. Mass (Da) pI pK1
(α-COOH) 		pK2
(α-+NH3)
آلانین A Ala 89.09404 6.01 2.35 9.87
سیستئین C Cys 121.15404 5.05 1.92 10.70
اسید آسپارتیک D Asp 133.10384 2.85 1.99 9.90
اسید گلوتامیک E Glu 147.13074 3.15 2.10 9.47
فنیل‌آلانین F Phe 165.19184 5.49 2.20 9.31
گلیسین G Gly 75.06714 6.06 2.35 9.78
هیستیدین H His 155.15634 7.60 1.80 9.33
ایزولوسین I Ile 131.17464 6.05 2.32 9.76
لیزین K Lys 146.18934 9.60 2.16 9.06
لوسین L Leu 131.17464 6.01 2.33 9.74
متیونین M Met 149.20784 5.74 2.13 9.28
آسپاراژین N Asn 132.11904 5.41 2.14 8.72
پیرولیزین O Pyl
پرولین P Pro 115.13194 6.30 1.95 10.64
گلوتامین Q Gln 146.14594 5.65 2.17 9.13
آرژینین R Arg 174.20274 10.76 1.82 8.99
سرین (اسید آمینه) S Ser 105.09344 5.68 2.19 9.21
ترئونین T Thr 119.12034 5.60 2.09 9.10
سلنوسیستئین U Sec 168.053
والین V Val 117.14784 6.00 2.39 9.74
تریپتوفان W Trp 204.22844 5.89 2.46 9.41
تیروزین Y Tyr 181.19124 5.64 2.20 9.21

خواص زنجیر جانبی

Amino Acid Short Abbrev. Side chain Hydro-
phobic 		pKa Polar pH Small Tiny Aromatic
or ترکیبات آلیفاتیک 		van der Waals
volume
آلانین A Ala -CH3 X - - - X X - 67
سیستئین C Cys -CH2SH - 8.18 - acidic X - - 86
اسید آسپارتیک D Asp -CH2COOH - 3.90 X acidic X - - 91
اسید گلوتامیک E Glu -CH2CH2COOH - 4.07 X acidic - - - 109
فنیل‌آلانین F Phe -CH2C6H5 X - - - - - Aromatic 135
گلیسین G Gly -H X - - - X X - 48
هیستیدین H His -CH2-C3H3N2 - 6.04 X weak basic - - Aromatic 118
ایزولوسین I Ile -CH(CH3)CH2CH3 X - - - - - Aliphatic 124
لیزین K Lys -(CH2)4NH2 - 10.54 X basic - - - 135
لوسین L Leu -CH2CH(CH3)2 X - - - - - Aliphatic 124
متیونین M Met -CH2CH2SCH3 X - - - - - - 124
آسپاراژین N Asn -CH2CONH2 - - X - X - - 96
پیرولیزین O Pyl
پرولین P Pro -CH2CH2CH2- X - - - X - - 90
گلوتامین Q Gln -CH2CH2CONH2 - - X - - - - 114
آرژینین R Arg -(CH2)3NH-C(NH)NH2 - 12.48 X strongly basic - - - 148
سرین (اسید آمینه) S Ser -CH2OH - - X - X X - 73
ترئونین T Thr -CH(OH)CH3 - - X weak acidic X - - 93
سلنوسیستئین U Sec -CH2SeH X 5.73 - - X - -
والین V Val -CH(CH3)2 X - - - X - Aliphatic 105
تریپتوفان W Trp -CH2C8H6N X - - - - - Aromatic 163
تیروزین Y Tyr -CH2-C6H4OH - 10.46 X - - - Aromatic 141

مشارکت‌کنندگان ویکی‌پدیا. «[http://en.wikipedia.org/w/index.php?title=Proteinogenic_amino_acid&oldid=242771085 

Ambrogelly A, Palioura S, Söll D (January 2007). "Natural expansion of the genetic code". Nature Chemical Biology. 3 (1): 29–35. doi:10.1038/nchembio847. PMID 17173027.
Lobanov AV, Turanov AA, Hatfield DL, Gladyshev VN (August 2010). "Dual functions of codons in the genetic code". Critical Reviews in Biochemistry and Molecular Biology. 45 (4): 257–65. doi:10.3109/10409231003786094. PMC 3311535. PMID 20446809.
Young VR (August 1994). "Adult amino acid requirements: the case for a major revision in current recommendations" (PDF). The Journal of Nutrition. 124 (8 Suppl): 1517S–1523S. doi:10.1093/jn/124.suppl_8.1517S. PMID 8064412.
Erives A (August 2011). "A model of proto-anti-codon RNA enzymes requiring L-amino acid homochirality". Journal of Molecular Evolution. 73 (1–2): 10–22. Bibcode:2011JMolE..73...10E. doi:10.1007/s00239-011-9453-4. PMC 3223571. PMID 21779963.
Frenkel-Pinter, Moran; Haynes, Jay W.; C, Martin; Petrov, Anton S.; Burcar, Bradley T.; Krishnamurthy, Ramanarayanan; Hud, Nicholas V.; Leman, Luke J.; Williams, Loren Dean (2019-08-13). "Selective incorporation of proteinaceous over nonproteinaceous cationic amino acids in model prebiotic oligomerization reactions". Proceedings of the National Academy of Sciences. 116 (33): 16338–16346. doi:10.1073/pnas.1904849116. ISSN 0027-8424. PMC 6697887. PMID 31358633. Proteinogenic amino acid]». در دانشنامهٔ ویکی‌پدیای انگلیسی، بازبینی‌شده در ۹ اکتبر ۲۰۰۸.

Новое сообщение