پیفم
Подписчиков: 0, рейтинг: 0
| محتوا | |
|---|---|
| توضیح | ارائهٔ همترازسازیها و مدلهای پنهان مارکوف برای دومِـینهای پروتئین |
| گونههای دادههای گرفتهشده |
خانوادههای پروتئین |
| ارگانیسمها | تمامی جانداران |
| تماس | |
| مرکز پژوهش | مؤسسهٔ بیوانفورماتیک اروپا |
| استناد ابتدایی | PubMed |
| دسترسی | |
| قالب دادهها | قالب استکهلم |
| وبگاه | pfam |
| نشانی اینترنتی دریافت | FTP 1 FTP 2 |
| گوناگون | |
| پروانه | گنو الجیپیال |
| نسخه | ۳۳٫۱ |
| نهادهای قابل بوکمارک | بله |
پیفَـم (انگلیسی: Pfam) که در انگلیسی برگرفته از عبارت «Protein families» است، یک پایگاه داده از خانوادههای پروتئین است که حاوی توصیف و توضیحنویسی و همچنین همترازسازی چند توالی است که با استفاده از مدل پنهان مارکوف ایجاد شدهاست. جدیدترین نسخهٔ پیفَـم، نسخهٔ ۳۳٫۱ است که در ماه مه ۲۰۲۰ میلادی بهروزرسانی شد و ۱۸٬۲۵۹ خانوادهٔ پروتئینی را در بر میگیرد.
پژوهشگران با مراجعه به پیفَـم میتوانند برای هر خانوادهٔ پروتئینی، این موارد را ببینند:
- توصیف هر خانوادهٔ پروتئینی
- مشاهدهٔ همترازسازی چند توالی
- دیدن ساختار دومین پروتئین
- بررسی توزیع گونهای
- ردگیری و تعقیب پیوندها به سایر پایگاههای داده
- مشاهدهٔ ساختمانهای شناختهشدهٔ پروتئینها
جستارهای وابسته
- مشارکتکنندگان ویکیپدیا. «Pfam». در دانشنامهٔ ویکیپدیای انگلیسی، بازبینیشده در ۸ ژانویه ۲۰۲۱.