پاک‌سازی ریشه (ای) یا ریشه‌پاک‌سازی یا تصفیه ریشه (ای) Rhizofiltration نوعی گیاه‌پالایی است که شامل فیلتر کردن آب‌های زیرزمینی آلوده، آب‌های سطحی و فاضلاب از طریق توده‌ای از ریشهها برای حذف مواد سمی یا مواد مغذی اضافی است.
برخی از رایج‌ترین گونه‌های گیاهی که توانایی حذف سموم از آب را از طریق پاک‌سازی ریشه نشان داده‌اند:
